阿尔科尔孔成立于1971年，俱乐部在最初的30年只能参加西班牙丁级联赛和地区联赛。2000-2001赛季，阿尔科孔完成了西班牙丙级联赛的首演，赛季末排名积分榜第12位，随后几个赛季基本上都是积分榜中游的位置。2008-09赛季，球队历史上第一次通过附加赛升入西乙。